Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms