Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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