Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1CQ53FD0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1CQ53FD0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms