Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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