Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms