Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NDUFA9Q16795 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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