Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SYPL1Q16563 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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SYPL1Q16563 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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