Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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