Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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