Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLCA4Q14CN2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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