Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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