Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IHHQ14623 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IHHQ14623 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IHHQ14623 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IHHQ14623 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IHHQ14623 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IHHQ14623 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IHHQ14623 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IHHQ14623 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IHHQ14623 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IHHQ14623 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IHHQ14623 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IHHQ14623 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IHHQ14623 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IHHQ14623 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IHHQ14623 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IHHQ14623 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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