Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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