Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms