Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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