Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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