Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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GRIK2Q13002 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GRIK2Q13002 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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