Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms