Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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NFIAQ12857 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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