Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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KCNMA1Q12791 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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