Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD47Q08722 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms