Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYRO3Q06418 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms