Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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