Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN2P57739 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms