Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms