Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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