Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNTC1P50748 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms