Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms