Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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