Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms