Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5AP29375 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms