Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCP25054 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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APCP25054 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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