Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms