Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEFHP12036 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEFHP12036 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEFHP12036 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEFHP12036 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEFHP12036 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms