Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSP90AB1P08238 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms