Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms