Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms