Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP2O43734 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms