Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TAF1C-217ENST00000566903 2628 ntTSL 516.28■□□□□ 0.22e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-212ENST00000564774 4637 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-209ENST00000564208 3810 ntTSL 211.59□□□□□ -0.552e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.621e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TMED9-202ENST00000505521 925 ntTSL 217.77■□□□□ 0.441e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 AUP1-204ENST00000463900 1645 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.321e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.171e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 512.53□□□□□ -0.41e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MYH9-203ENST00000456729 449 ntTSL 311.22□□□□□ -0.611e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 FANCA-207ENST00000561667 528 ntTSL 410.98□□□□□ -0.653e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 39.7□□□□□ -0.863e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.413e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.183e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.483e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.533e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.92■□□□□ 0.788e-12■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.328e-12■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.623e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 TKFC-218ENST00000533853 460 ntTSL 310.86□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-9■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.87□□□□□ -1.632e-9■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-9■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-9■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.271e-21■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 315.94■□□□□ 0.141e-21■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.011e-21■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 MYL5-203ENST00000503300 1780 ntTSL 221.52■■□□□ 1.041e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.031e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 MYL5-202ENST00000502720 551 ntTSL 416.69■□□□□ 0.261e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 HSPA8-217ENST00000532182 674 ntTSL 410.72□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 HSPA8-204ENST00000524590 536 ntTSL 53.21□□□□□ -1.91e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.196e-7■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.296e-7■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 56.37□□□□□ -1.396e-7■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 522.38■■□□□ 1.178e-7■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.418e-7■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.278e-7■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.238e-7■□□□□ 9.4
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PRPF4O43172 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 518.67■□□□□ 0.589e-8■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 EWSR1-221ENST00000610553 2300 ntTSL 218.09■□□□□ 0.499e-8■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 217.7■□□□□ 0.429e-8■□□□□ 9.4
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PRPF4O43172 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 316.25■□□□□ 0.196e-7■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 MAN2C1-207ENST00000562228 734 ntTSL 313.73□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 SLC12A4-216ENST00000576377 868 ntTSL 513.42□□□□□ -0.261e-10■□□□□ 9.4
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PRPF4O43172 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.871e-6■□□□□ 9.4
PRPF4O43172 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 217.6■□□□□ 0.411e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-206ENST00000577380 554 ntTSL 423.67■■□□□ 1.383e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-211ENST00000579707 566 ntTSL 520.67■□□□□ 0.93e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-224ENST00000582186 565 ntTSL 420.61■□□□□ 0.893e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.863e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-230ENST00000584383 500 ntTSL 320.35■□□□□ 0.853e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-220ENST00000581519 545 ntTSL 419.89■□□□□ 0.773e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TRA2A-206ENST00000482395 661 ntTSL 219.8■□□□□ 0.763e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-225ENST00000582455 564 ntTSL 416.42■□□□□ 0.223e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-233ENST00000585277 581 ntTSL 315.97■□□□□ 0.153e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 GRB7-212ENST00000584053 584 ntTSL 415.74■□□□□ 0.113e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 DNHD1-220ENST00000534210 2867 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.053e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 NDST1-203ENST00000518346 496 ntTSL 314.4□□□□□ -0.13e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-213ENST00000580416 430 ntTSL 412.87□□□□□ -0.353e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SELENOI-204ENST00000462301 424 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.443e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SELENOI-203ENST00000447170 624 ntTSL 511.32□□□□□ -0.63e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 DNHD1-216ENST00000532027 4881 ntTSL 211.2□□□□□ -0.623e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM94-218ENST00000581252 522 ntTSL 510.97□□□□□ -0.653e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.063e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.333e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.393e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.393e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SELENOI-202ENST00000442141 504 ntTSL 54.86□□□□□ -1.633e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.683e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TCIRG1-208ENST00000529364 868 ntTSL 315.02■□□□□ -05e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 TMEM256-202ENST00000575427 403 ntTSL 212.12□□□□□ -0.475e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-8■□□□□ 9.3
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