Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNMO15061 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNMO15061 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms