Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PCH4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PCH4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PCH4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PCH4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PCH4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E9PCH4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E9PCH4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PCH4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PCH4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms