Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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