Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms