Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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