Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4S1Q9Y587 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms