Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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