Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms