Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms