Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH22Q9UJ99 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH22Q9UJ99 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH22Q9UJ99 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH22Q9UJ99 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH22Q9UJ99 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH22Q9UJ99 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH22Q9UJ99 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms