Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms